刚刚结束阿罗拉冒险旅行的小智，遇上了来自世界之外的系统，那这样的旅途又会发生怎样精彩的故事！（目前的主线为新无印旅途……）...
《神奇宝贝：系统开局》第1-50章
- 第1章 相遇
- 第2章 绑定系统
- 第3章 小智演戏
- 第4章 小春
- 第5章 洛奇亚
- 第6章 洛奇亚vs皮卡丘
- 第7章 千万伏特和空气爆裂的对撞
- 第8章 算计小豪
- 第9章 我的目标神奇宝贝大师
- 第10章 特别研究员
- 第11章 第一个研究所任务
- 第12章 火箭队三人组登场
- 第13章 喷火龙救场
- 第14章 和小春组成搭档
- 第15章 皮卡丘vs大钢蛇
- 第16章 前往迦勒尔地区
- 第17章 玻璃哨杯
- 第18章 从神奥来的波加曼
- 第19章 水上竞速赛
- 第20章 神秘水滴
- 第21章 寻找凤王
- 第22章 召唤凤王
- 第23章 约战凤王
- 第24章 喷火龙vs凤王
- 第25章 龙之喷射火焰
- 第26章 寻找快龙岛
- 第27章 学习龙之舞
- 第28章 解救快龙
- 第29章 收服快龙
- 第30章 闹鬼了
- 第31章 羁绊进化玉石
- 第32章 燃烧吧，进化的开始
- 第33章 小智·喷火龙
- 第34章 世界锦标赛
- 第35章 丹帝
- 第36章 超极巨化
- 第37章 他是阿罗拉联盟初代冠军
- 第38章 智喷vs丹喷
- 第39章 超强极限爆焰弹Vs超极巨地狱灭炎
- 第40章 世界锦标赛的规则
- 第41章 报名参加世界锦标赛
- 第42章 收服泥偶巨人
- 第43章 耿鬼再来
- 第44章 倒霉的小智
- 第45章 徒手搓波导弹
- 第46章 失落的耿鬼
- 第47章 以一敌二的耿鬼
- 第48章 收服耿鬼
- 第49章 耿鬼的复仇之战，秒杀
- 第50章 世锦赛连胜
- 第51章 皮卡丘vs雷丘
